Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Foxe3Q9QY14 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Foxe3Q9QY14 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Foxe3Q9QY14 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Foxe3Q9QY14 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Foxe3Q9QY14 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Foxe3Q9QY14 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Foxe3Q9QY14 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Foxe3Q9QY14 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Foxe3Q9QY14 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.7
Foxe3Q9QY14 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Foxe3Q9QY14 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Foxe3Q9QY14 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Foxe3Q9QY14 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Foxe3Q9QY14 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Foxe3Q9QY14 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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