Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpc5Q9QX29 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpc5Q9QX29 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms