Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Vstm2bQ9JME9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vstm2bQ9JME9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vstm2bQ9JME9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vstm2bQ9JME9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Vstm2bQ9JME9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Vstm2bQ9JME9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vstm2bQ9JME9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms