Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM62

Reep6, Receptor expression-enhancing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep6Q9JM62 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Reep6Q9JM62 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Reep6Q9JM62 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Reep6Q9JM62 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Reep6Q9JM62 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Reep6Q9JM62 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Reep6Q9JM62 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Reep6Q9JM62 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Reep6Q9JM62 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Reep6Q9JM62 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Reep6Q9JM62 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Reep6Q9JM62 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Reep6Q9JM62 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Reep6Q9JM62 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Reep6Q9JM62 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Reep6Q9JM62 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Reep6Q9JM62 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Reep6Q9JM62 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Reep6Q9JM62 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Reep6Q9JM62 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Reep6Q9JM62 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Reep6Q9JM62 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Reep6Q9JM62 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Reep6Q9JM62 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Reep6Q9JM62 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Reep6Q9JM62 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Reep6Q9JM62 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Reep6Q9JM62 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Reep6Q9JM62 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Reep6Q9JM62 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms