Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM05

Pias4, E3 SUMO-protein ligase PIAS4, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pias4Q9JM05 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pias4Q9JM05 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pias4Q9JM05 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pias4Q9JM05 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pias4Q9JM05 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pias4Q9JM05 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pias4Q9JM05 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pias4Q9JM05 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pias4Q9JM05 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pias4Q9JM05 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pias4Q9JM05 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pias4Q9JM05 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pias4Q9JM05 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pias4Q9JM05 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pias4Q9JM05 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pias4Q9JM05 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pias4Q9JM05 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pias4Q9JM05 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pias4Q9JM05 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pias4Q9JM05 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pias4Q9JM05 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pias4Q9JM05 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pias4Q9JM05 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pias4Q9JM05 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pias4Q9JM05 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pias4Q9JM05 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pias4Q9JM05 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pias4Q9JM05 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pias4Q9JM05 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pias4Q9JM05 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pias4Q9JM05 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pias4Q9JM05 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pias4Q9JM05 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pias4Q9JM05 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pias4Q9JM05 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pias4Q9JM05 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pias4Q9JM05 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pias4Q9JM05 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pias4Q9JM05 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pias4Q9JM05 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pias4Q9JM05 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms