Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cabp1Q9JLK7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cabp1Q9JLK7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Cabp1Q9JLK7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cabp1Q9JLK7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cabp1Q9JLK7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cabp1Q9JLK7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cabp1Q9JLK7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cabp1Q9JLK7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cabp1Q9JLK7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cabp1Q9JLK7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Cabp1Q9JLK7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cabp1Q9JLK7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cabp1Q9JLK7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cabp1Q9JLK7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cabp1Q9JLK7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cabp1Q9JLK7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cabp1Q9JLK7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cabp1Q9JLK7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cabp1Q9JLK7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cabp1Q9JLK7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cabp1Q9JLK7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cabp1Q9JLK7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cabp1Q9JLK7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cabp1Q9JLK7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cabp1Q9JLK7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cabp1Q9JLK7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cabp1Q9JLK7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cabp1Q9JLK7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cabp1Q9JLK7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cabp1Q9JLK7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Cabp1Q9JLK7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cabp1Q9JLK7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cabp1Q9JLK7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cabp1Q9JLK7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cabp1Q9JLK7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cabp1Q9JLK7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cabp1Q9JLK7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cabp1Q9JLK7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cabp1Q9JLK7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cabp1Q9JLK7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cabp1Q9JLK7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cabp1Q9JLK7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms