Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Upk3aQ9JKX8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Upk3aQ9JKX8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms