Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ldb3Q9JKS4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ldb3Q9JKS4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms