Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Irx5Q9JKQ4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Irx5Q9JKQ4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Irx5Q9JKQ4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms