Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chrac1Q9JKP8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms