Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cyp39a1Q9JKJ9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cyp39a1Q9JKJ9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cyp39a1Q9JKJ9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cyp39a1Q9JKJ9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cyp39a1Q9JKJ9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cyp39a1Q9JKJ9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cyp39a1Q9JKJ9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms