Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trem3Q9JKE1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms