Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ap3m1Q9JKC8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ap3m1Q9JKC8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms