Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Bco1Q9JJS6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Bco1Q9JJS6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bco1Q9JJS6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Bco1Q9JJS6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bco1Q9JJS6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bco1Q9JJS6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bco1Q9JJS6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bco1Q9JJS6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bco1Q9JJS6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bco1Q9JJS6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bco1Q9JJS6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bco1Q9JJS6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bco1Q9JJS6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bco1Q9JJS6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bco1Q9JJS6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bco1Q9JJS6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bco1Q9JJS6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bco1Q9JJS6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bco1Q9JJS6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Bco1Q9JJS6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bco1Q9JJS6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bco1Q9JJS6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Bco1Q9JJS6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bco1Q9JJS6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bco1Q9JJS6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bco1Q9JJS6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bco1Q9JJS6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bco1Q9JJS6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bco1Q9JJS6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bco1Q9JJS6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Bco1Q9JJS6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bco1Q9JJS6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bco1Q9JJS6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bco1Q9JJS6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bco1Q9JJS6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bco1Q9JJS6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bco1Q9JJS6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bco1Q9JJS6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bco1Q9JJS6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bco1Q9JJS6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bco1Q9JJS6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms