Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJQ0

Pigb, GPI mannosyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PigbQ9JJQ0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PigbQ9JJQ0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PigbQ9JJQ0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PigbQ9JJQ0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PigbQ9JJQ0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PigbQ9JJQ0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PigbQ9JJQ0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PigbQ9JJQ0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PigbQ9JJQ0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PigbQ9JJQ0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PigbQ9JJQ0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PigbQ9JJQ0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PigbQ9JJQ0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PigbQ9JJQ0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PigbQ9JJQ0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PigbQ9JJQ0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PigbQ9JJQ0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PigbQ9JJQ0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PigbQ9JJQ0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PigbQ9JJQ0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PigbQ9JJQ0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PigbQ9JJQ0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PigbQ9JJQ0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PigbQ9JJQ0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PigbQ9JJQ0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PigbQ9JJQ0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PigbQ9JJQ0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PigbQ9JJQ0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PigbQ9JJQ0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PigbQ9JJQ0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PigbQ9JJQ0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PigbQ9JJQ0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PigbQ9JJQ0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PigbQ9JJQ0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PigbQ9JJQ0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PigbQ9JJQ0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PigbQ9JJQ0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PigbQ9JJQ0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PigbQ9JJQ0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PigbQ9JJQ0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PigbQ9JJQ0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PigbQ9JJQ0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PigbQ9JJQ0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PigbQ9JJQ0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PigbQ9JJQ0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PigbQ9JJQ0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PigbQ9JJQ0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PigbQ9JJQ0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PigbQ9JJQ0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PigbQ9JJQ0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PigbQ9JJQ0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PigbQ9JJQ0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PigbQ9JJQ0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PigbQ9JJQ0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PigbQ9JJQ0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PigbQ9JJQ0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PigbQ9JJQ0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PigbQ9JJQ0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PigbQ9JJQ0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PigbQ9JJQ0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PigbQ9JJQ0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PigbQ9JJQ0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PigbQ9JJQ0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PigbQ9JJQ0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PigbQ9JJQ0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PigbQ9JJQ0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PigbQ9JJQ0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PigbQ9JJQ0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PigbQ9JJQ0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PigbQ9JJQ0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PigbQ9JJQ0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PigbQ9JJQ0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PigbQ9JJQ0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PigbQ9JJQ0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PigbQ9JJQ0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PigbQ9JJQ0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PigbQ9JJQ0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PigbQ9JJQ0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PigbQ9JJQ0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PigbQ9JJQ0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PigbQ9JJQ0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PigbQ9JJQ0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PigbQ9JJQ0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PigbQ9JJQ0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PigbQ9JJQ0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PigbQ9JJQ0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PigbQ9JJQ0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PigbQ9JJQ0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PigbQ9JJQ0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PigbQ9JJQ0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PigbQ9JJQ0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PigbQ9JJQ0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PigbQ9JJQ0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PigbQ9JJQ0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PigbQ9JJQ0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PigbQ9JJQ0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PigbQ9JJQ0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PigbQ9JJQ0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PigbQ9JJQ0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PigbQ9JJQ0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms