Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ctnnbip1Q9JJN6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ctnnbip1Q9JJN6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms