Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc12a4Q9JIS8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc12a4Q9JIS8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc12a4Q9JIS8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc12a4Q9JIS8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc12a4Q9JIS8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc12a4Q9JIS8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms