Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pus3Q9JI38 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pus3Q9JI38 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pus3Q9JI38 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pus3Q9JI38 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pus3Q9JI38 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pus3Q9JI38 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Pus3Q9JI38 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pus3Q9JI38 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pus3Q9JI38 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pus3Q9JI38 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pus3Q9JI38 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Pus3Q9JI38 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pus3Q9JI38 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pus3Q9JI38 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pus3Q9JI38 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pus3Q9JI38 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms