Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHH9

Copz2, Coatomer subunit zeta-2, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz2Q9JHH9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copz2Q9JHH9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copz2Q9JHH9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copz2Q9JHH9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copz2Q9JHH9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copz2Q9JHH9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copz2Q9JHH9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copz2Q9JHH9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copz2Q9JHH9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copz2Q9JHH9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copz2Q9JHH9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copz2Q9JHH9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copz2Q9JHH9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copz2Q9JHH9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copz2Q9JHH9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copz2Q9JHH9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copz2Q9JHH9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copz2Q9JHH9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copz2Q9JHH9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copz2Q9JHH9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copz2Q9JHH9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copz2Q9JHH9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copz2Q9JHH9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copz2Q9JHH9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copz2Q9JHH9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copz2Q9JHH9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copz2Q9JHH9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copz2Q9JHH9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copz2Q9JHH9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copz2Q9JHH9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copz2Q9JHH9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copz2Q9JHH9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copz2Q9JHH9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copz2Q9JHH9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copz2Q9JHH9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copz2Q9JHH9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copz2Q9JHH9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copz2Q9JHH9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copz2Q9JHH9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copz2Q9JHH9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copz2Q9JHH9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copz2Q9JHH9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copz2Q9JHH9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copz2Q9JHH9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copz2Q9JHH9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copz2Q9JHH9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copz2Q9JHH9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copz2Q9JHH9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copz2Q9JHH9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copz2Q9JHH9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Copz2Q9JHH9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Copz2Q9JHH9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Copz2Q9JHH9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Copz2Q9JHH9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Copz2Q9JHH9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Copz2Q9JHH9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Copz2Q9JHH9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Copz2Q9JHH9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Copz2Q9JHH9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Copz2Q9JHH9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Copz2Q9JHH9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Copz2Q9JHH9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Copz2Q9JHH9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Copz2Q9JHH9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Copz2Q9JHH9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Copz2Q9JHH9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Copz2Q9JHH9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Copz2Q9JHH9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Copz2Q9JHH9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Copz2Q9JHH9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Copz2Q9JHH9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Copz2Q9JHH9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Copz2Q9JHH9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Copz2Q9JHH9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Copz2Q9JHH9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Copz2Q9JHH9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Copz2Q9JHH9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Copz2Q9JHH9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Copz2Q9JHH9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Copz2Q9JHH9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Copz2Q9JHH9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Copz2Q9JHH9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Copz2Q9JHH9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Copz2Q9JHH9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Copz2Q9JHH9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Copz2Q9JHH9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Copz2Q9JHH9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Copz2Q9JHH9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Copz2Q9JHH9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Copz2Q9JHH9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Copz2Q9JHH9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Copz2Q9JHH9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Copz2Q9JHH9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Copz2Q9JHH9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Copz2Q9JHH9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Copz2Q9JHH9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Copz2Q9JHH9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Copz2Q9JHH9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Copz2Q9JHH9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Copz2Q9JHH9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms