Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHH5

Cxcl11, C-X-C motif chemokine 11, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl11Q9JHH5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cxcl11Q9JHH5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Cxcl11Q9JHH5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cxcl11Q9JHH5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cxcl11Q9JHH5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cxcl11Q9JHH5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cxcl11Q9JHH5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cxcl11Q9JHH5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cxcl11Q9JHH5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cxcl11Q9JHH5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cxcl11Q9JHH5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cxcl11Q9JHH5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cxcl11Q9JHH5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cxcl11Q9JHH5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cxcl11Q9JHH5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cxcl11Q9JHH5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cxcl11Q9JHH5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cxcl11Q9JHH5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cxcl11Q9JHH5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cxcl11Q9JHH5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cxcl11Q9JHH5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cxcl11Q9JHH5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cxcl11Q9JHH5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cxcl11Q9JHH5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cxcl11Q9JHH5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cxcl11Q9JHH5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cxcl11Q9JHH5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cxcl11Q9JHH5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cxcl11Q9JHH5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cxcl11Q9JHH5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cxcl11Q9JHH5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cxcl11Q9JHH5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cxcl11Q9JHH5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cxcl11Q9JHH5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cxcl11Q9JHH5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cxcl11Q9JHH5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cxcl11Q9JHH5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms