Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn12Q9ET43 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn12Q9ET43 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms