Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ropn1Q9ESG2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ropn1Q9ESG2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ropn1Q9ESG2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ropn1Q9ESG2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ropn1Q9ESG2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ropn1Q9ESG2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ropn1Q9ESG2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ropn1Q9ESG2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ropn1Q9ESG2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ropn1Q9ESG2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ropn1Q9ESG2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ropn1Q9ESG2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ropn1Q9ESG2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ropn1Q9ESG2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ropn1Q9ESG2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ropn1Q9ESG2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ropn1Q9ESG2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ropn1Q9ESG2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ropn1Q9ESG2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ropn1Q9ESG2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ropn1Q9ESG2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ropn1Q9ESG2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ropn1Q9ESG2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ropn1Q9ESG2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ropn1Q9ESG2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ropn1Q9ESG2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ropn1Q9ESG2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ropn1Q9ESG2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ropn1Q9ESG2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ropn1Q9ESG2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ropn1Q9ESG2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ropn1Q9ESG2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ropn1Q9ESG2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ropn1Q9ESG2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ropn1Q9ESG2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ropn1Q9ESG2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ropn1Q9ESG2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ropn1Q9ESG2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ropn1Q9ESG2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ropn1Q9ESG2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ropn1Q9ESG2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ropn1Q9ESG2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ropn1Q9ESG2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ropn1Q9ESG2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ropn1Q9ESG2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ropn1Q9ESG2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ropn1Q9ESG2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ropn1Q9ESG2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ropn1Q9ESG2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ropn1Q9ESG2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ropn1Q9ESG2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ropn1Q9ESG2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ropn1Q9ESG2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ropn1Q9ESG2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ropn1Q9ESG2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ropn1Q9ESG2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms