Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ube3bQ9ES34 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ube3bQ9ES34 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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