Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Chrnb2Q9ERK7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chrnb2Q9ERK7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121 ms