Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndst3Q9EQH7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Ndst3Q9EQH7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ndst3Q9EQH7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ndst3Q9EQH7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ndst3Q9EQH7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Ndst3Q9EQH7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndst3Q9EQH7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndst3Q9EQH7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndst3Q9EQH7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndst3Q9EQH7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndst3Q9EQH7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndst3Q9EQH7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndst3Q9EQH7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndst3Q9EQH7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndst3Q9EQH7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndst3Q9EQH7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndst3Q9EQH7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndst3Q9EQH7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndst3Q9EQH7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndst3Q9EQH7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndst3Q9EQH7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndst3Q9EQH7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ndst3Q9EQH7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ndst3Q9EQH7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndst3Q9EQH7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms