Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQC0

Chst1, Carbohydrate sulfotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst1Q9EQC0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chst1Q9EQC0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chst1Q9EQC0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chst1Q9EQC0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chst1Q9EQC0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms