Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rpgrip1Q9EPQ2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Rpgrip1Q9EPQ2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rpgrip1Q9EPQ2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rpgrip1Q9EPQ2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rpgrip1Q9EPQ2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms