Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL6

Mmp1b, Interstitial collagenase B, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp1bQ9EPL6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp1bQ9EPL6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp1bQ9EPL6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms