Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnft1Q9DCN7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnft1Q9DCN7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms