Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBS1

Tmem43, Transmembrane protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem43Q9DBS1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem43Q9DBS1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem43Q9DBS1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem43Q9DBS1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem43Q9DBS1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem43Q9DBS1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem43Q9DBS1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem43Q9DBS1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem43Q9DBS1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem43Q9DBS1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem43Q9DBS1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem43Q9DBS1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem43Q9DBS1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem43Q9DBS1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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