Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrpraQ9DBG7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrpraQ9DBG7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms