Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAK2

Pacrg, Parkin coregulated gene protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PacrgQ9DAK2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PacrgQ9DAK2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PacrgQ9DAK2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PacrgQ9DAK2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms