Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9DA42 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9DA42 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9DA42 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9DA42 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9DA42 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9DA42 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9DA42 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9DA42 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9DA42 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9DA42 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9DA42 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9DA42 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9DA42 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9DA42 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9DA42 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9DA42 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9DA42 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9DA42 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9DA42 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9DA42 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9DA42 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9DA42 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9DA42 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9DA42 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9DA42 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9DA42 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9DA42 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9DA42 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9DA42 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9DA42 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9DA42 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9DA42 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9DA42 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9DA42 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9DA42 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9DA42 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9DA42 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9DA42 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9DA42 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9DA42 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9DA42 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9DA42 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9DA42 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9DA42 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9DA42 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9DA42 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9DA42 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9DA42 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9DA42 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9DA42 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9DA42 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9DA42 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9DA42 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9DA42 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9DA42 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9DA42 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9DA42 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9DA42 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9DA42 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9DA42 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9DA42 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9DA42 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9DA42 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9DA42 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9DA42 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9DA42 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9DA42 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9DA42 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9DA42 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9DA42 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9DA42 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9DA42 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9DA42 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9DA42 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9DA42 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9DA42 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9DA42 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9DA42 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9DA42 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9DA42 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9DA42 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9DA42 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9DA42 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9DA42 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9DA42 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9DA42 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9DA42 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9DA42 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9DA42 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9DA42 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9DA42 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9DA42 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9DA42 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9DA42 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9DA42 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9DA42 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9DA42 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9DA42 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9DA42 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms