Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smco2Q9DA21 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smco2Q9DA21 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms