Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z1

Knstrn, Small kinetochore-associated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KnstrnQ9D9Z1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KnstrnQ9D9Z1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KnstrnQ9D9Z1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KnstrnQ9D9Z1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KnstrnQ9D9Z1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms