Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn34b2Q9D9N2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn34b2Q9D9N2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn34b2Q9D9N2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn34b2Q9D9N2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn34b2Q9D9N2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn34b2Q9D9N2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn34b2Q9D9N2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn34b2Q9D9N2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn34b2Q9D9N2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn34b2Q9D9N2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn34b2Q9D9N2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn34b2Q9D9N2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn34b2Q9D9N2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldn34b2Q9D9N2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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