Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdzd9Q9D9M4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Pdzd9Q9D9M4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Pdzd9Q9D9M4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdzd9Q9D9M4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdzd9Q9D9M4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdzd9Q9D9M4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdzd9Q9D9M4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdzd9Q9D9M4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdzd9Q9D9M4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdzd9Q9D9M4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdzd9Q9D9M4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdzd9Q9D9M4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdzd9Q9D9M4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdzd9Q9D9M4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdzd9Q9D9M4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdzd9Q9D9M4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdzd9Q9D9M4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdzd9Q9D9M4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdzd9Q9D9M4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdzd9Q9D9M4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdzd9Q9D9M4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdzd9Q9D9M4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdzd9Q9D9M4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdzd9Q9D9M4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdzd9Q9D9M4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdzd9Q9D9M4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdzd9Q9D9M4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdzd9Q9D9M4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdzd9Q9D9M4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdzd9Q9D9M4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdzd9Q9D9M4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdzd9Q9D9M4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdzd9Q9D9M4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdzd9Q9D9M4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdzd9Q9D9M4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
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