Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Chmp4bQ9D8B3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Chmp4bQ9D8B3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chmp4bQ9D8B3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms