Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmigd1Q9D7L8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms