Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Cldn23Q9D7D7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Cldn23Q9D7D7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Cldn23Q9D7D7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn23Q9D7D7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn23Q9D7D7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn23Q9D7D7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn23Q9D7D7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn23Q9D7D7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn23Q9D7D7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn23Q9D7D7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn23Q9D7D7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn23Q9D7D7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn23Q9D7D7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn23Q9D7D7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn23Q9D7D7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn23Q9D7D7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn23Q9D7D7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn23Q9D7D7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn23Q9D7D7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn23Q9D7D7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn23Q9D7D7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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