Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc3Q9D6Y1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc3Q9D6Y1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms