Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Ptp4a3Q9D658 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptp4a3Q9D658 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms