Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

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Length 937 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc39Q9D5Y1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc39Q9D5Y1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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