Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PudpQ9D5U5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PudpQ9D5U5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms