Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U0

Lpcat2b, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat2bQ9D5U0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lpcat2bQ9D5U0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lpcat2bQ9D5U0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms