Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Speer4f1Q9D5Q6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms