Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sf3a3Q9D554 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3a3Q9D554 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms