Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lonrf3Q9D4H7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lonrf3Q9D4H7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lonrf3Q9D4H7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms