Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmbr1lQ9D1E5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmbr1lQ9D1E5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmbr1lQ9D1E5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms