Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mrpl28Q9D1B9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl28Q9D1B9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms